MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017167	CGC	2	6	301121	301126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134095
6003	NC_017167	GCA	2	6	301133	301138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134095
6004	NC_017167	GCTCGG	2	12	301140	301151	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384134095
6005	NC_017167	GGT	2	6	301269	301274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134095
6006	NC_017167	GCC	2	6	301293	301298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134095
6007	NC_017167	CCA	2	6	301353	301358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134095
6008	NC_017167	GCG	2	6	301362	301367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134095
6009	NC_017167	CGG	2	6	301385	301390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134095
6010	NC_017167	CGT	2	6	301433	301438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134095
6011	NC_017167	A	6	6	301479	301484	100 %	0 %	0 %	0 %	384134095
6012	NC_017167	GC	3	6	301491	301496	0 %	0 %	50 %	50 %	384134095
6013	NC_017167	CG	3	6	301539	301544	0 %	0 %	50 %	50 %	384134095
6014	NC_017167	CGG	2	6	301548	301553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134095
6015	NC_017167	ATC	2	6	301585	301590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134095
6016	NC_017167	CGTG	2	8	301637	301644	0 %	25 %	50 %	25 %	384134096
6017	NC_017167	CCG	2	6	301687	301692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134096
6018	NC_017167	ACA	2	6	301750	301755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134096
6019	NC_017167	ACG	2	6	301776	301781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134096
6020	NC_017167	GGC	2	6	301799	301804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134096
6021	NC_017167	AGC	2	6	301833	301838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134096
6022	NC_017167	GCT	2	6	301852	301857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134096
6023	NC_017167	GCC	2	6	301893	301898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134096
6024	NC_017167	GC	3	6	301921	301926	0 %	0 %	50 %	50 %	384134096
6025	NC_017167	GCGTG	2	10	301939	301948	0 %	20 %	60 %	20 %	384134096
6026	NC_017167	CGG	2	6	301972	301977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134096
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6029	NC_017167	GGT	2	6	302093	302098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134096
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6032	NC_017167	CAGC	2	8	302198	302205	25 %	0 %	25 %	50 %	384134096
6033	NC_017167	CCGA	2	8	302220	302227	25 %	0 %	25 %	50 %	384134096
6034	NC_017167	ACG	2	6	302289	302294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134096
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6043	NC_017167	CGA	2	6	302770	302775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134096
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6045	NC_017167	GC	3	6	302959	302964	0 %	0 %	50 %	50 %	384134096
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6055	NC_017167	CT	3	6	303471	303476	0 %	50 %	0 %	50 %	384134097
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6057	NC_017167	GGGC	2	8	303562	303569	0 %	0 %	75 %	25 %	384134097
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6062	NC_017167	CG	3	6	303725	303730	0 %	0 %	50 %	50 %	384134097
6063	NC_017167	GGA	2	6	303759	303764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134097
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6124	NC_017167	CAC	2	6	306813	306818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134100
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6226	NC_017167	GC	3	6	311617	311622	0 %	0 %	50 %	50 %	384134103
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6230	NC_017167	CT	3	6	311834	311839	0 %	50 %	0 %	50 %	384134103
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6238	NC_017167	AGG	2	6	312088	312093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134103
6239	NC_017167	CGC	2	6	312100	312105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134103
6240	NC_017167	GTG	2	6	312108	312113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134103
6241	NC_017167	CAT	2	6	312215	312220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134103
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6243	NC_017167	AGGC	2	8	312265	312272	25 %	0 %	50 %	25 %	384134103
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6347	NC_017167	CCATC	2	10	317034	317043	20 %	20 %	0 %	60 %	384134107
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6356	NC_017167	CCTGG	2	10	317319	317328	0 %	20 %	40 %	40 %	384134107
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6359	NC_017167	CGG	2	6	317423	317428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134107
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6362	NC_017167	GTC	2	6	317696	317701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134108
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6484	NC_017167	CGT	2	6	324140	324145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134113
6485	NC_017167	GCA	2	6	324146	324151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134113
6486	NC_017167	GC	3	6	324152	324157	0 %	0 %	50 %	50 %	384134113
6487	NC_017167	GTG	2	6	324255	324260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134113
6488	NC_017167	GA	4	8	324291	324298	50 %	0 %	50 %	0 %	384134113
6489	NC_017167	GGC	2	6	324323	324328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134113
6490	NC_017167	AGG	2	6	324352	324357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134113
6491	NC_017167	GCAGAC	2	12	324396	324407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134114
6492	NC_017167	CGC	2	6	324411	324416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134114
6493	NC_017167	GC	3	6	324415	324420	0 %	0 %	50 %	50 %	384134114
6494	NC_017167	CAT	2	6	324441	324446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134114
6495	NC_017167	CAA	2	6	324460	324465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134114
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6497	NC_017167	TGC	2	6	324557	324562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134114
6498	NC_017167	TCC	2	6	324605	324610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134114
6499	NC_017167	TCGC	2	8	324808	324815	0 %	25 %	25 %	50 %	384134114
6500	NC_017167	TTGT	2	8	324829	324836	0 %	75 %	25 %	0 %	384134114

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